目的 研究成年蜂猴的腸道菌群組成情況，以探討人工圈養(yǎng)蜂猴的健康影響因素。
方法 采集4只成年雄 性蜂猴的糞便樣本，運(yùn)用細(xì)菌16S rDNA通用引物擴(kuò)增V4區(qū)，應(yīng)用Illumina NovaSeq測(cè)序平臺(tái)對(duì)蜂猴糞便微生物進(jìn) 行測(cè)序分析，并使用Qiime軟件分析樣本的復(fù)雜度和相似度?；谟行?shù)據(jù)分析樣本腸道菌群在門(mén)、屬水平上的物 種結(jié)構(gòu)和豐度，同時(shí)應(yīng)用PICRUSt軟件進(jìn)行菌群的代謝功能預(yù)測(cè)。
結(jié)果 年齡最小的蜂猴的腸道菌群多樣性指數(shù) shannon高于其他蜂猴。PCoA分析顯示4只蜂猴的樣本菌群組成具有一定的相似度。4只蜂猴的糞便中細(xì)菌共鑒定 出了12個(gè)門(mén)、18個(gè)綱、28個(gè)目、49個(gè)科、93個(gè)屬和59個(gè)種。其中，優(yōu)勢(shì)菌門(mén)是擬桿菌門(mén) （Bacteroidetes） 和厚 壁 菌 門(mén) （Firmicutes）， 平 均 相 對(duì) 豐 度 分 別 為 46% 和 28%； 擬 桿 菌 屬 （Bacteroides）、 雙 歧 桿 菌 屬 （Bifidobacterium） 和梭菌屬 （Fusobacterium） 的豐度較高，平均相對(duì)豐度分別為33%、6%和6%；有益菌群雙 歧桿菌屬在4個(gè)蜂猴糞便樣本中都存在，且在年齡較小的蜂猴中相對(duì)豐度最高。PICRUSt功能預(yù)測(cè)分析顯示，蜂猴 糞便菌群中氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝、碳水化合物轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝等功能基因的豐度相對(duì)較高。
結(jié)論 應(yīng)用Illumina NovaSeq 高通量測(cè)序技術(shù)可以較全面地檢測(cè)蜂猴的糞便菌群。蜂猴糞便中細(xì)菌組成具有豐富的多樣性，其中還有許多未被分 類(lèi)鑒定且相對(duì)豐度較高的細(xì)菌，需要進(jìn)一步研究。
閱讀原文：基于高通量測(cè)序技術(shù)分析人工圈養(yǎng)成年蜂猴的糞便微生物多樣性.pdf
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