TEL:17312606166（魏經(jīng)理）
美鳳力臨床前大動物實驗中心
17312606166
近日，西北農(nóng)林科技大學(xué)羊遺傳改良與生物育種團(tuán)隊攜手國內(nèi)外多家科研機(jī)構(gòu)，在綿羊和山羊腸道微生物基因組數(shù)據(jù)庫構(gòu)建及腸道粘蛋白和多糖代謝功能菌種挖掘方面取得進(jìn)展，研究成果發(fā)表在Microbiome上。
研究團(tuán)隊在全國范圍內(nèi)的32個羊場收集了來自21個綿羊和山羊品種共計320個腸道樣本，分別構(gòu)建了包含1.6億和8千萬非冗余基因的綿羊和山羊腸道微生物基因集目錄SMGC和GMGC，其數(shù)據(jù)覆蓋率高達(dá)80%。對比分析發(fā)現(xiàn)，山羊和綿羊腸道微生物基因集中共享了4900萬個非冗余基因和1138個菌種，研究詳細(xì)解析了綿羊和山羊后腸微生物在多糖和黏蛋白代謝通路中的功能差異，并揭示了飼養(yǎng)環(huán)境對山羊腸道微生物結(jié)構(gòu)和功能的潛在影響。
通過Binning組裝技術(shù)，團(tuán)隊構(gòu)建了擁有5810個中高質(zhì)量微生物基因組的數(shù)據(jù)庫，其中包括38個菌株級別的基因組和3149個物種級別的基因組，且從中識別出2661個先前未經(jīng)確認(rèn)的新型細(xì)菌。這一數(shù)據(jù)庫的建立使GTDB基因組數(shù)據(jù)庫的細(xì)菌多樣性提高了約9.3%。研究在綿羊腸道中鑒別出91個特異性定植的細(xì)菌，其基因組富含大量與黏蛋白代謝相關(guān)的功能基因和多糖利用位點，有力證明了綿羊特有的微生物群在代謝黏蛋白和多糖方面的強(qiáng)大功能潛力。
綿羊和山羊腸道微生物基因集及代謝聚糖和黏蛋白的功能特性。特異定植于綿羊的91個細(xì)菌的系統(tǒng)發(fā)育樹及其多糖利用位點。（課題組供圖）
相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1186/s40168-024-01806-z
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