目的 以自發(fā)突變導(dǎo)致的小頭、震顫(microcephaly and seizure,mise)斑馬魚(yú)為模型,研究其遺傳方式 和突變基因定位。
方法 通過(guò)比較正常和突變體斑馬魚(yú)的頭寬和眼球面積,鑒定突變體的小頭小眼性狀;通過(guò)構(gòu) 建家系確定突變遺傳方式。 對(duì)極端表型群體進(jìn)行基因組重測(cè)序,隨后利用分離群體分組分析( bulked segregation analysis,BSA)和競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性 PCR(kompetitive allele specific PCR,KASP),一代測(cè)序等方法獲得突變基因 定位。
結(jié)果 與野生型相比,突變體 mise 受精后 3 d(3 days post fertilization,3 dpf)表現(xiàn)為小頭小眼震顫表型。 經(jīng) 基因定位及驗(yàn)證明確與表型相關(guān)的突變基因?yàn)?terfa。
結(jié)論 本研究通過(guò)全基因組重測(cè)序結(jié)合連鎖分析的方法快 速定位突變基因,可為斑馬魚(yú)突變體的基因定位提供參考,為神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育異常的相關(guān)基因功能分析奠定基礎(chǔ)。
原文內(nèi)容：斑馬魚(yú)小頭震顫突變體mise的鑒定與基因定位.pdf
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